官署名。明代南京各卫指挥机关。设指挥使一人，指挥同知二人，指挥佥事四人及镇抚司、经历司等。共四十九卫，其中三十二卫分隶南京五军都督府，十七卫为亲军卫。并听南京中军都督府节制。